Partner dan Kerjasama oleh Madrasah Ibtidaiyah Negeri Malang 1 telah banyak dilakukan, baik itu berskala lokal, nasional, maupun internasional. Di antaranya adalah:
• Kerjasama menggalang persahabatan dalam bentuk surat menyurat dengan: Comboyne Public School Hill, New South Wales, Australia dan Seaford Primary School, Australia.
• Kerjasama dengan lintas sektoral baik dengan lembaga pemerintah (Depag, Diknas, dll), LPTK dan lembaga swadaya masyarakat lainnya dalam menunjang pembalajaran.
• Kerjasama non formal dengan pihak-pihak tertentu untuk mendukung dalam pelaksanaan event di MIN Malang 1, seperti jasa antar jemput, travel, bus wisata, dan lain-lain.
Selain itu guna lebih meningkatkan kualitas dalam manajemen, kurikulum, dan program-program yang lain, Madrasah Ibtidaiyah Negeri Malang 1 juga mengadakan program Madrasah Terpadu, yaitu kerjasama yang dilakukan dengan:
• Madrasah Aliyah Negeri 1 Malang
• Madrasah Tsanawiyah Negeri 1 Malang
